Institución de educación superior propia del Consejo Regional Indígena del Cauca (CRIC), creada como respuesta a la necesidad de fortalecer los procesos educativos, políticos y culturales de los pueblos indígenas del Cauca y la necesidad de formación propia.

La UAIIN se fundamenta en los principios de autonomía, interculturalidad, territorio y comunidad, configurándose como un espacio de formación que dialoga con los saberes ancestrales, las luchas territoriales y las dinámicas organizativas de los pueblos indígenas.Su proyecto educativo se orienta al fortalecimiento de los planes de vida comunitarios, a la defensa del territorio y a la construcción de alternativas políticas, económicas y culturales desde las comunidades.

La universidad ofrece programas de formación en áreas como educación, derecho, desarrollo comunitario, salud y comunicación, articulando conocimientos propios con saberes occidentales en un ejercicio de diálogo intercultural. Su labor pedagógica se desarrolla en comunidades indígenas del Cauca, configurando espacios de aprendizaje situados en el territorio y orientados a la transformación social.